Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FOXC1Q12948 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 BPIFB5P-201ENST00000457066 1099 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FOXC1Q12948 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms