Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CHD3Q12873 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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CHD3Q12873 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHD3Q12873 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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