Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KCNH2Q12809 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms