Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DDR1Q08345 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms