Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
APBA1Q02410 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
APBA1Q02410 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms