Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN7AQ01118 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms