Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MDM2Q00987 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms