Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GALNT15-203ENST00000437509 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 BMP2-201ENST00000378827 3601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MDGA1-207ENST00000505425 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DHX30-206ENST00000446256 3660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TP53I11-220ENST00000533940 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PSMD2-205ENST00000435761 2574 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CBX1P83916 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms