Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMF1P82094 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMF1P82094 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms