Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 MPP2-219ENST00000612133 4938 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 KIAA0513-201ENST00000258180 7404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
HERVK_113P63121 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms