Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ABCE1P61221 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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