Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BACE1P56817 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BACE1P56817 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BACE1P56817 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BACE1P56817 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BACE1P56817 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BACE1P56817 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BACE1P56817 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms