Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
EPHB3P54753 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms