Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC5A3P53794 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC5A3P53794 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms