Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GJA8P48165 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GJA8P48165 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms