Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CTNNA1P35221 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms