Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA13P31271 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms