Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF2E1P29083 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GTF2E1P29083 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms