Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
HLA-DMAP28067 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PDE9A-201ENST00000291539 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HLA-DMAP28067 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms