Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ARPP19-206ENST00000564163 718 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRBP23467 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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PTPRBP23467 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PTPRBP23467 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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