Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ODC1P11926 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
ODC1P11926 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms