Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
F13BP05160 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
F13BP05160 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
F13BP05160 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms