Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATG7O95352 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms