Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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SMAD6O43541 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SMAD6O43541 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SMAD6O43541 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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