Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC169A6NNP5 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms