Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARID3CA6NKF2 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms