Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 FAAP24-203ENST00000589646 836 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC005746.3-201ENST00000614751 393 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
XIRP2A4UGR9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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