Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MTMR11A4FU01 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms