Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
VAX2Q9UIW0 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms