Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CGGBP1Q9UFW8 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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