Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP35Q9P2H5 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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USP35Q9P2H5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP35Q9P2H5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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