Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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CNTN3Q9P232 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNTN3Q9P232 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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