Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00597Q9H2U6 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms