Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PUS3Q9BZE2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms