Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
MCMBPQ9BTE3 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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