Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FYCO1Q9BQS8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FYCO1Q9BQS8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms