Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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NOTCH4Q99466 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NOTCH4Q99466 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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