Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 GPR45-201ENST00000258456 1307 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 OR7E12P-201ENST00000344740 973 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 BX322562.1-201ENST00000617004 561 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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EP400Q96L91 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 NANOS3-201ENST00000339133 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EP400Q96L91 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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