Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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SUSD3Q96L08 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUSD3Q96L08 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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