Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CCDC97Q96F63 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms