Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
GTF3C6Q969F1 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
GTF3C6Q969F1 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms