Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP2A3Q93084 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ATP2A3Q93084 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms