Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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RNF128Q8TEB7 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF128Q8TEB7 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF128Q8TEB7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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