Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ATAD1Q8NBU5 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ATAD1Q8NBU5 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms