Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RYBPQ8N488 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYBPQ8N488 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms