Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC50Q8IVM0 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC50Q8IVM0 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms