Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG4DQ86TL0 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms