Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6L0

PRRT2, Proline-rich transmembrane protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT2Q7Z6L0 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRRT2Q7Z6L0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms