Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms