Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMN6

CAPRIN2, Caprin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN2Q6IMN6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPRIN2Q6IMN6 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms